Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ntn3Q9R1A3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ntn3Q9R1A3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ntn3Q9R1A3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms