Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms