Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Col4a4Q9QZR9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Col4a4Q9QZR9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Col4a4Q9QZR9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Col4a4Q9QZR9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Col4a4Q9QZR9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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