Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms