Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gpc1Q9QZF2 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms