Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms