Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rdh11Q9QYF1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms