Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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