Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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