Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms