Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.5 ms