Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms