Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms