Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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