Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms