Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms