Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms