Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms