Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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