Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Capn12Q9ER56 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Capn12Q9ER56 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Capn12Q9ER56 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Capn12Q9ER56 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms