Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufs3Q9DCT2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms