Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms