Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Csnk1dQ9DC28 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Csnk1dQ9DC28 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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