Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms