Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc97Q9DBT3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc97Q9DBT3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc97Q9DBT3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc97Q9DBT3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc97Q9DBT3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms