Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms