Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrmuQ9DAT5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrmuQ9DAT5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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