Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms