Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmem239Q9DA47 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms