Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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