Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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