Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310002L09RikQ9D7L5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms