Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms