Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q9D727 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D727 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms