Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MsraQ9D6Y7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MsraQ9D6Y7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms