Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms