Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms