Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcc1Q9D4H2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms