Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrp2bpQ9D4C6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms