Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms