Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms