Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag1Q9D3E6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms