Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2U0

Psg23, MCG140255, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg23Q9D2U0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Psg23Q9D2U0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psg23Q9D2U0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms