Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D2Q3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Q9D2Q3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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