Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms