Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms