Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hddc3Q9D114 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hddc3Q9D114 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hddc3Q9D114 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hddc3Q9D114 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hddc3Q9D114 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hddc3Q9D114 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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