Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms