Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zbed3Q9D0L1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zbed3Q9D0L1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zbed3Q9D0L1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
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Zbed3Q9D0L1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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