Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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